Алексей Владимирович Яблоков родился 3 октября 1933 года в Москве, в семье ученых. Его отец был доктором геолого-минералогических наук, мать – палеонтологом, доктором биологических наук.
В 1956 году, окончив биолого-почвенный факультет МГУ, Яблоков начал работать лаборантом. В 1959 году он получил ученую степень кандидата биологических наук, в 1966 году – степень доктора, а в 1976-м – звание профессора. С 1967 по 1989 годы работал в лаборатории постнатального онтогенеза в Институте биологии развития им. Кольцова АН СССР. В 1984 году Яблоков стал членом-корреспондентом Академии наук СССР, с 1997 до 2005 года занимал должность главного научного сотрудника Института биологии развития Российской академии наук.
В область научных интересов Алексея Яблокова входили: биология морских млекопитающих, популяционная и эволюционная биология, экология (в том числе проблема радиоактивного загрязнения морей). В 1960–1965 годах Яблоков проводил экспедиционные исследования в Белом, Баренцевом, Гренландском, Карском, Беринговом и Охотском морях, где в естественной среде изучал китов, дельфинов, тюленей. Он описал способы адаптации животных к водному образу жизни и разработал классификацию окраски китообразных.
В 1988–1991 годах Яблоков стал основателем и сопредседателем организации Гринпис* в СССР, в 1987–2009 годах – основателем и председателем президиума Московского общества защиты животных. Также он был основателем и почетным членом международной организации «Парламентарии мира за окружающую среду» и вице-президентом Совета Всемирного союза охраны природы.
Алексей Яблоков написал свыше 460 научных работ в области популяционной биологии, экологии, радиобиологии, охраны природы. В их числе – 24 монографии и учебника, часть которых издана в США, Германии, Японии, Индии и других странах.
Помимо научной работы Алексей Яблоков занимался государственной и политической деятельностью. С 1989 года на протяжении более чем 10 лет он занимал ряд государственных должностей в сфере экологии и здравоохранения, был почетным председателем Московского общества защиты животных и председателем фракции «Зеленая Россия» партии «Яблоко».
Алексей Владимирович Яблоков скончался 10 января 2017 года в Москве.
*Деятельность организации признана нежелательной на территории Российской Федерации (решение Генеральной прокуратуры РФ от 18.05.2023, распоряжение Минюста России №703-р от 29.05.2023 )