Группа компаний «Р-Фарм» основана в 2001 году и за первые годы существования группой по всей территории России выстроена сеть филиалов, а также заключены партнерские соглашения с ведущими разработчиками и производителями фармацевтической продукции. Кроме того, в 2007 году группа получила сертификат Trace International о соответствии «Р-Фарм» международным бизнес-стандартам.
В 2009 году компания начала формировать собственный вертикально интегрированный холдинг, включающий этапы от производства фармпрепаратов до их дистрибуции. В рамках проекта начато строительство собственного фармацевтического завода в Ярославле.
В 2010 году компания приобрела акции ОАО «Новосибхимфарм», а также завод «Ортат» в Костромской области. Деятельность компании расширяется новыми направлениями – лабораторной диагностикой и медицинской техникой.
К концу 2012 года производственные мощности компании существенно возросли, начато строительство современного научно-производственного комплекса «Фармославль». На заводе в Ярославле успешно проведены аудиты ведущих мировых производителей лекарственных препаратов.
В 2013 году «Р-Фарм» получила результаты клинических исследований первых собственных препаратов, а также стала членом Ассоциации международных фармацевтических производителей.
В 2014 году компания приобрела высокотехнологичный завод по производству твердых лекарственных форм в Германии.
В 2018 году начато строительство нового фармацевтического комплекса в Москве. Приобретена «Фабрика радиотерапевтической техники».
В 2019 году запущен научно-производственный комплекс «Фармославль».
В 2020 году компания запустила производство первой российской вакцины против коронавируса «Спутник V».
В 2021 году «Р-Фарм» приобрела фармацевтический завод Teva.
В настоящее время компания продолжает активное развитие, запланировано строительство производства лекарственных средств в Санкт-Петербурге. Ведутся активные разработки новых фармацевтических препаратов. По итогам 2020 года «Р-Фарм» возглавила рейтинг 20 фармкомпаний России, составленный Forbes.